Dois meses e meio depois de ter sido demitido do Ministério da Saúde, Eduardo Pazuello ganhou um cargo no Palácio do Planalto. Ele vai assumir a função de Secretário de Estudos e Estratégias, que é um cargo da Secretaria de Assuntos Estratégicos da Presidência da República.
Pazuello responde a um procedimento disciplinar no Exército, por ter participado de um ato político em apoio ao presidente Jair Bolsonaro (sem partido), no dia 3 de maio, o que é proibido para militares da ativa.
O ex-ministro também responde a um inquérito na Justiça Federal, no Distrito Federal, por suposta omissão no enfrentamento da pandemia no Amazonas, especialmente no colapso da saúde em Manaus.
No mês de abril, o Ministério Público Federal denunciou Eduardo Pazuello em uma ação por improbidade administrativa no Amazonas. O processo corre em segredo de justiça.
Pazuello ficará subordinado ao almirante Flávio Rocha, que é secretário de Assuntos Estratégicos de Governo.